基于注意力的深度嵌入聚类方法

作  者: 梁栋
摘  要: 新一代的单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)为研究细胞异质性和功能多样性提供新途径,在单细胞转录组数据中,聚类计算是十分重要的步骤,聚类效果的好坏决定后续下游分析效果,但 scRNA-seq 数据的高维性、稀疏性和高噪声等问题都为聚类计算带来极大挑战。受到注意力机制应用的启发,本文设计一个基于特征选择的深度嵌入聚类方法 scADC,使用注意力机制对单细胞转录组数据的基因表达矩阵进行计算,选择更有代表性的基因,然后通过去噪自编码器学习数据的潜在特征表示,最终得到聚类结果,通过公开数据集上的实验验证,scADC 有着不错的表现。
来  源: 《信息产业报道》 2025-01